Cartographie des initiatives de la médecine de précision SLA

News Analysis: Richard Robinson

La collecte de données de masse concernant la sclérose latérale amyotrophique (SLA) a commencée, engendrant enthousiasme et induisant des attentes d’améliorations du diagnostic et des soins des patients. Les avancées dans la puissance des méthodes de calcul, l’explosion des méthodes à haut-débit pour étudier les acides nucléiques, les protéines et les autres molécules cellulaires, le développement des cellules souches pluripotentes induites (iPSCs) et les améliorations rapides en robotique et dans d’autres technologies permettent d’étudier les différentes cellules des patients à un niveau de détail sans précédent et de relier les données de plusieurs milliers de patients pour identifier des causalités qui étaient tout simplement introuvables jusqu’à présent.

Plusieurs initiatives importantes sont actuellement en cours pour recueillir et analyser ces données de pALS, elles visent toutes à déceler des causes de la maladie, des biomarqueurs et des traitements. Ces traitements seront guidés par les principes de la médecine de précision où les traitements les plus efficaces ciblent le processus pathologique du patient individuel en « prenant en compte la variabilité individuelle génétique, l’environnement et mode de vie de chaque personne » (NIH précision Medicine Initiative Cohort Program, 2015).

L’approche de la médecine de précision a inauguré une nouvelle ère thérapeutique anticancéreuse (Friedman et al., 2015) et semble particulièrement prometteuse pour la SLA, compte tenu de l’hétérogénéité clinique et génétique de la maladie (Cooper-Knock, J et al., 2014;Xu, SW et al., 2014; Sabatelli, M. et al. 2016). Plus d’une douzaine de gènes, actifs dans des domaines aussi diverses que la genèse de l’ARN, le transport nucléaire, le dysfonctionnement mitochondrial et le transport axonal, sont associés à la SLA. Des différences frappantes existent, en outre, dans les manifestations cliniques en ce qui concerne l’âge, l’emplacement du début et le rythme de progression de la maladie, avec un impact sur la fonction cognitive.

Une note sur le partage de données et leur intégration : si chacun des projets en cours a du potentiel pour faire avancer la compréhension des mécanismes et l’identification de nouvelles cibles pour la SLA, une opportunité encore plus grande émergera de la combinaison des ensembles de données, permettant des analyses groupées sur plusieurs milliers de pALS. Un des plus grands défis sera, dans un avenir proche, l’élaboration de protocoles de partage des ensembles de données.

Selon Bernard Muller, un entrepreneur et pALS qui a co-initié le projet MinE : "Nous devons élaborer un plan de partage en collaboration avec les scientifiques qui peuvent nous aider à concevoir une infrastructure correcte des données. Le travail que nous faisons maintenant afin de planifier l’intégration des données provenant de différents projets aura des implications majeures pour le bon déroulement du reste. Il y a des défis techniques, mais ceux-ci peuvent être résolus. Les obstacles juridiques aux partages de données au-delà des frontières, qui seront nécessaires à l’intégration des données de tous les projets en cours, seront probablement plus importants ".

Selon Mueller, le travail pour surmonter ces obstacles vient seulement de commencer. Comme indiqué ci-dessous et dans les descriptions de projet, les chefs de projet anticipent les défis techniques et juridiques et sont en train de planifier la voie à suivre. Beaucoup de détails sont encore en cours d’élaboration à la date de la publication de cet article.

Cet article fournit une vue d’ensemble des projets actuels en médecine de précision ou de récolte de métadonnées SLA, principalement aux États-Unis. Il contient des renseignements recueillis sur les sites Web des programmes, ainsi que lors d’entrevues de l’ALS Research Forum avec les directeurs de projet ou les chercheurs principaux. L’ALS Research Forum met régulièrement à jour les descriptions de chaque projet et fournit plus de détails sur la portée, la progression et les ressources disponibles pour la communauté des chercheurs. Nous voulons, pour faire avancer la recherche SLA, être une référence pour la communauté des chercheurs SLA en mettant en évidence les possibilités de collaborations et les nouvelles ressources.

● Project Mine
● The ALS Therapy Development Institute Precision Medicine Program
● Clinical Research In ALS And Related Disorders For Therapeutic Development (CReATe) Consortium
● Genomic Translation for ALS Care (GTAC)
● Center For Genomics Of Neurodegenerative Disease at the New York Genome Center (CGND)
● Answer ALS
● Neurolincs

Bases de données disponibles pour les chercheurs

● NeuroBank
● Pooled Resource Open-access Als Clinical Trials (PRO-ACT)
● ALSGEN
● dbGaP

Perspectives pour l’avenir :  le résultat de toutes ces initiatives devrait être une meilleure compréhension des mécanismes divers de la SLA et la capacité d’identifier les mécanismes qui opèrent chez chaque patient individuel. La capacité de cataloguer les patients par mécanisme permettra d’obtenir des populations plus homogènes pour les essais cliniques, moins nombreuses (grâce à la diminution des variations de l’échantillon) et plus aptes à tester, sur des patients dont la maladie est induite par un mécanisme, une thérapie axée sur ce mécanisme. Ces efforts seront facilités par d’autres initiatives d’essais cliniques SLA, y compris un projet majeur de test et d’affinement des mesures et résultats de l’ALS-FRS (ALS Functional Rating Scale, échelle de mesure fonctionnelle SLA) par Biogen, voir news de février 2016, et les études visant à définir des biomarqueurs de la progression de la maladie pour améliorer les mesures cliniques de cette progression.

Traduction : Fabien

Source : The ALS Research Forum