Analyse réseau co-expression gène pondéré du sang périphérique des patients Sclérose Latérale Amyotrophique

La Sclérose Latérale Amyotrophique (SLA) est une maladie létal caractérisée par la dégénération progressive des neurones moteurs dans le cerveau et la moelle épinière. La diagnose est principalement basée sur des symptômes cliniques, et pour l’instant il n’y a aucune thérapie pour arrêter la maladie ou pour ralentir sa progression.

Vue que l’accès au tissue de la moelle épinière n’est pas possible au commencement de la maladie, nous avons examiné les changements dans les profiles d’expression de gène, dans le sang entier des patients SLA.

Résultats: Notre étude transcription a démontré des changements dramatiques dans le sang des patients SLA; 2.300 essais (9.4 %) démontraient une expression sensiblement différentielle dans un dataset de découverte consistant de 30 patients SLA et 30 personnes saines. L’analyse de réseau co-expression gène pondéré (WGCNA) était utilisée pour trouver des réseaux reliés à la maladie (modules) et des gènes hub reliés à maladie.

Deux modules co-expression larges étaient trouvés pour être associées avec la SLA. Nos résultats étaient répliqués dans une seconde (30 patients et 30 contrôles) et un troisième dataset (63 patients et 63 contrôles), alors démontrant une association signifiante et consistante des deux modules co-expression larges avec le statut de maladie SLA.

L’analyse Route Esprit des gènes modèles reliés à la SLA implique l’enrichissement des catégories fonctionnelles reliées aux maladies génétiques, neurodégénération du système nerveux et des maladies inflammatoires. Les modules reliés à la SLA contiennent un nombre de gènes candidats possiblement concerné dans la pathogénèse de la SLA.

Conclusions: La première étude grande-échelle d’expression de gène sang dans la SLA observait des patrons distincts entre les cas et les contrôles qui pourraient fournir des opportunités pour le développement des bios marqueurs aussi bien que des nouvelles visions dans les mécanismes moléculaires de la maladie.

Traduire: Joke Mulleners

Source: ALS Independence