Genoom-brede associatie studie identificeert 19p13.3 (UNC13A) en 9p21.2 als gevoelige loci voor sporadische Amyotrofische Laterale Sclerose.

10-07-2012

Departement Neurologie, Rudolf Magnus Instituut voor Neurowetenschappen, Universitair Medisch Centrum Utrecht, Utrecht, Nederland.

Abstract

Wij hebben een genoom-brede associatie studie onder 2,323 personen met sporadische Amyotrofische Laterale Sclerose (ALS) en 9,013 controlepersonen uitgevoerd en alle SNPs met p < 1.0 x 10(-4) in een tweede, onafhankelijke cohort van 2,532 getroffen individuen en 5,940 controlepersonen geëvalueerd. Uit analyse van de genoom-brede gegevens bleek genoom-brede significantie voor een SNP, rs12608932, met P = 1,30 x 10(-9). Deze SNP vertoonde solide replicatie in de tweede cohort (P = 1,86 x 10(-6)), en een gecombineerde analyse over de twee fasen leverde een P = 2,53 x 10(-14). De SNP rs12608932 bevindt zich op chromosoom 19p13.3 en mapt met een haplotype blok binnen de grenzen van UNC13A, die de vrijlating van neurotransmitters zoals glutamaat, bij neuromusculaire synapsen regelt. Follow-up van extra SNPs toonde genoom-brede significantie voor twee andere SNPs (rs2814707, met P = 7,45 x 10(-9), en rs3849942, met P = 1.01 x 10(-8)) in de gecombineerde analyse van beide fasen. Deze SNPs bevinden zich op chromosoom 9p21.2, in een regio die familiale ALS met frontotemporale lobaire degeneratie koppelt zoals eerder gevonden in verschillende grote stambomen.

Vertaling: ALS Liga: Anne

Bron: PubMed

Share