Genoom-wijde associatie analyses identificeren nieuwe risico varianten en genetische architectuur van amyotrofische laterale sclerose

Om de genetische architectuur van amyotrofische laterale sclerose (ALS) te ontrafelen en geassocieerde loci te vinden hebben we een referentie panel met persoonlijke imputatie samengesteld voor genetische analyse van het volledige genoom van patiënten met ALS en gelijkaardige controles (n = 1.861). Door imputatie en associatie analyse volgens het gemengd model bij 12.577 personen en 23.475 controles, gecombineerd met 2.579 personen en 2.767 controles in een onafhankelijke replicatie cohorte, hebben we de locatie van een nieuwe risico locus teruggebracht tot een nauw gebied op chromosoom 21, en identificeerden C21orf2 als een gen geassocieerd met ALS-risico. Bijkomend identificeerden we MOBP en SCFD1 als nieuwe geassocieerde risico loci. We bekwamen evidentie dat ALS een complex genetisch kluwen is met een polygenetische architectuur. Verder hebben we de SNP-gebaseerde overerfbaarheid ingeschat op 8,5%schatten, met een specifieke en belangrijke rol voor varianten met lage frequentie (frequentie 1-10%). Deze studie verantwoordt het onderzoeken van grotere aantallen stalen met het analyseren van het volledige genoom om zeldzame oorzakelijke varianten te identificeren die het ALS-risico onderstrepen.

Vertaling: ALS Liga: Dirk

Bron: Nature Genetics, online 25 juli 2016, doi:10.1038/ng.3622