Analyses pan génomiques d’association identifient de nouvelles variantes à risque et l’architecture génétique de la sclérose latérale amyotrophique

Pour élucider l’architecture génétique de la sclérose latérale amyotrophique (SLA) et pour trouver des loci associés, nous avons assemblé un panel de référence avec imputation personnalisée de l’ensemble des génomes séquencés des patients atteints de SLA et des personnes de contrôle appariées (n = 1 861). Par le biais d’imputation et l’analyse d’association selon le modèle mixte de 12 577 cas et 23 475 contrôles, et combiné avec 2 579 cas et 2 767 contrôles dans une cohorte de réplication indépendante, nous avons détaillé un nouveau locus à risque sur le chromosome 21 et identifié le C21orf2 comme un gène à risque SLA. En outre, nous avons identifié MOBP et SCFD1 comme nouveaux loci à risque. Nous avons établi des preuves que la SLA est un trait génétique complexe ayant une architecture de type polygénique. En outre, nous avons estimé l’héritabilité basée sur les SNP à 8,5 %, avec un rôle distinct et important pour les variantes à fréquence basse (fréquence de 1 à 10 %). Cette étude justifie l’examen de plus d’échantillons pan génomiques afin d’identifier des variantes causales rares qui soulignent le risque SLA. 

Traduction : Ligue SLA : Anne

Source : Nature Genetics, Publié en ligne le 25 juillet 2016, doi:10.1038/ng.3622