Effets modificateurs de la maladie d'une variante structurelle du SCAF4 dans une cohorte principalement de SLA SOD1

Abstrait

Objectif
Pour tester l'hypothèse selon laquelle le rs573116164 aura des effets modificateurs de la maladie chez les patients atteints de sclérose latérale amyotrophique familiale (FALS) de superoxyde dismutase 1 (SOD1), nous avons caractérisé rs573116164 au sein d'une cohorte de 190 patients atteints de fALS et 560 contrôles sains de même âge pour évaluer la variante pour l'association avec diverses mesures de la maladie.

Méthodes 
En utilisant un algorithme d'évaluation bio-informatique décrit précédemment, une variante de structure courte polymorphe associée à SOD1 a été identifiée en fonction de son effet théorique sur l'expression des gènes. Une répétition de 12 à 18 poly-T (rs573116164) dans la région non traduite 3 'du facteur 4 associé au domaine carboxy terminal lié aux protéines riches en sérine et en arginine (SCAF4), un gène adjacent à SOD1, a été évaluée pour l'association et l'influence de la maladie. sur la survie et l'âge au début dans une cohorte fALS utilisant la PCR, le séquençage de Sanger et les techniques de séparation capillaire pour la détection des allèles.

Résultats 
Dans une cohorte nord-américaine de patients fALS à prédominance SOD1 (n = 190) et de témoins sains de même âge (n = 560), nous avons montré que le port d'un allèle 18T SCAF4 était associé à une maladie au sein de cette cohorte (rapport de cotes [OU] 6,6; intervalle de confiance à 95% [IC] 3,9–11,2; p = 4,0e-11), mais aussi dans les cas non SOD1 (n = 27; OR 5,3; IC à 95% 1,9–14,5; p = 0,0014). Cette découverte suggère des effets génétiquement indépendants de la SOD1 du SCAF4 sur la sensibilité au fALS. De plus, le port d'un allèle 18T était associé à une réduction de 26 mois du temps de survie (IC à 95% 6,6–40,8; p = 0,014), mais n'a pas affecté l'âge au début de la maladie.

Conclusions 
Les résultats de cette cohorte fALS suggèrent que le rs573116164 pourrait avoir une pertinence indépendante et plus large de la SOD1 dans la SLA, justifiant une enquête plus approfondie dans d'autres cohortes fALS et ALS sporadiques, ainsi que des études des effets fonctionnels de la variante 18T sur l'expression des gènes.

Traduction : Christina Lambrecht

Source : Neurology Genetics