L’analyse génétique de la sclérose latérale amyotrophique identifie les voies contributives et les types de cellules
17-08-2020
Résumé
Malgré les progrès considérables dans la découverte des causes génétiques de la sclérose latérale amyotrophique (SLA), nous ne comprenons pas entièrement les mécanismes moléculaires sous-jacents à la maladie. Nous avons analysé des données à l’échelle du génome impliquant 78.500 individus en utilisant une approche de score de risque polygénique pour identifier les voies biologiques et les types de cellules impliqués dans la SLA. Cette approche axée sur les données a identifié de multiples aspects de la biologie sous-jacente à la maladie qui se sont résolus en thèmes plus larges, à savoir la morphogenèse par projection neuronale, le trafic membranaire et la transduction du signal, médiée par les ribonucléotides. Nous avons également constaté que le risque génomique dans la SLA correspond systématiquement aux interneurones corticaux GABAergiques et oligodendrocytes, comme le confirment les données d’ARN-seq à un seul noyau humain. En utilisant la randomisation mendélienne à deux échantillons, nous avons désigné cinq gènes différentiellement exprimés (ATG16L2 ACSL5, MAPILC3A, PLXNB2 et SCFD1) dans les voies significatives pertinentes pour la SLA. Nous concluons que les étiologies génétiques disparates de cette maladie neurologique mortelle convergent vers un plus petit nombre de voies communes finales et de types de cellules.
Traduction : Gerda Eynatten-Bové
Source : bioRxiv